MBC881殺菌劑使用方法一：系統運行時在保安過濾器前面加入，加藥時間可定為30分鐘。在進水加藥前應將透過水直接排放，停止加藥后清洗系統15分鐘，檢查系統電導，清洗直到產水電導達到規范要求，將系統切換回正常操作。該方法須注意，系統加MBC881殺菌劑前進行過清洗，保安過濾器必須是清潔的；MBC881殺菌劑必須原液不稀釋投加，系統如沒有單獨的加藥點可于加阻垢劑處加入，MBC881殺菌劑和MDC220阻垢劑不能混合后一齊加，因此加MBC881時必須停加阻垢劑。如有單獨的加藥點例外。該方法的加藥量是：360ppm。每一到二周加藥一次。 

MBC881殺菌劑使用方法二：利用系統的清洗裝置循環殺菌。MBC881殺菌劑的配藥濃度800ppm，中間補充一次，循環時間30分鐘。對二級RO的殺菌也可以用該方法。殺菌后對系統進行運行清洗15分鐘（方法同一）。

一般采用二種方法